OBIS

Courses tagged with "OBIS"

Contributing datasets to EMODnet Biology

Category: 2020

Training originally set up for EMODnet Biology Partners (June 2020). During the Summer of 2020, this training course was opened up for self-enrolment, allowing all scientists & data managers access to its content. This way, they can use the available material to learn how to format, standardize and quality control their biological data for submission to e.g. the European node of the Ocean Biodiversity Information System (EurOBIS) or any other node within the OBIS network.
  • Course Editor / Instructor: Joana Beja
  • Course Editor / Instructor: Menashè Eliezer
  • Course Editor / Instructor: Salvador Fernández Bejarano
  • Course Editor / Instructor: Vasilis Gerovasileiou
  • Course Editor / Instructor: Ruben Perez
  • Course Editor / Instructor: Gizem Poffyn
  • Course Editor / Instructor: Leen Vandepitte

Métodos de Estudio de Biodiversidad Marina en Litorales Rocosos / Biological Essential Ocean Variables (EOVs) for the analysis of marine biodiversity patterns in rocky shores

Category: 2019
En este taller se estudian los diversos métodos para estimar la biodiversidad de los litorales rocosos y sus organismos asociados. Específicamente se evalúan y comparan los métodos de observación directa vs las estimaciones basadas en foto-cuadratas. Se discutirá el uso de aves marinas como portadores de sensores oceanográficos y cómo elaborar historias en realidad virtual sobre estos ecosistemas. Note:  please explore the contents of this course as a self-learning course. Please note however that the contents of this training course were designed for a face to face context. As such, some features (assignments, discussion fora, etc) may not work properly and we cannot ensure tutor support. For any queries please contact ioc.training@unesco.org and we will do our best to redir…
  • Course Editor / Instructor: Gregorio Bigatti
  • Course Editor / Instructor: Eduardo Klein
  • Course Editor / Instructor: Patricia Miloslavich
  • Course Editor / Instructor: Enrique Montes

Administración de Datos Biogeográficos (Contribuyendo al uso de OBIS)

Category: 2019
El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (The Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización, utilización de R. Metas y Objetivos Ampliar la red de colaboradores OBIS Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados a través de OBIS y sus nodos del OBIS Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especi…
  • Course Editor / Instructor: Ward Appeltans
  • Course Editor / Instructor: Eduardo Klein
  • Course Editor / Instructor: Ana Carolina Peralta

MBON Pole to Pole of the Americas: Tools for the analysis of coastal biodiversity using OBIS and remote sensing data

Category: 2019
The MBON Pole to Pole effort seeks to develop a framework for the collection, use and sharing of marine biodiversity data in a coordinated, standardized manner leveraging on existing infrastructure managed by the Global Ocean Observing System (GOOS; IOC-UNESCO), the GEO Biodiversity Observation Network (GEO BON), and the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). The MBON Pole to Pole aims to become a key resource for decision-making and management of living resource across countries in the Americas for reporting requirements under the Intergovernmental Science-Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services (IPBES), Aichi Targets of the Convention of Biological Diversity (CBD), and the UN 2030 Agenda for Sustainable Development Goals (SDGs).  This course a follow up of the M…
  • Course Editor / Instructor: Eduardo Klein

Administración de Datos Biogeográficos Marinos (Contribuyendo al Uso de OBIS)

Category: 2018
El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización. Metas y Objetivos Ampliar la red de colaboradores OBIS. Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos. Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos. Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS. Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicacione…

Marine Biogeographic Data Management (Contributing and using OBIS)

Category: 2018
The course provides an introduction to the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). This includes best practices in marine biogeographic data management, data publication, data access, data analysis and data visualisation. With the numerous datasets being generated through various projects and some old data yet to be captured in the database, this training provides an opportunity to manage this wealth of scientific knowledge.
  • Course Editor / Instructor: Ward Appeltans
  • Course Editor / Instructor: Harrison Ong'anda

Marine Biogeographic Data processing using OBIS

Category: 2018

The course provides an introduction to the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). This includes best practices in marine biogeographic data management, data publication, data access, data analysis and data visualisation. With the numerous datasets being generated through various projects and some old data yet to be captured in the database, this training provides an opportunity to manage this wealth of scientific knowledge.
  • Course Editor / Instructor: Greg Reed

Marine Species Distribution Modeling

Category: 2018
The training course Marine Species Distribution modeling covers the background knowledge on marine biogeography, and the technical aspects needed to develop Species Distribution Models. Students will be trained in the basics of statistical modeling and guided through the modeling phases: compile distribution data from open access databases (e.g. OBIS) and environmental information from publically available ecological data layers using Geographic Information Systems, make informed decisions on parameter settings and select the best methods for developing distribution models, forecast distributions under different Climate Change scenarios, validate models and incorporate results in scientific manuscripts and technical reports. The course includes theoretic…
  • Course Editor / Instructor: Ward Appeltans
  • Course Editor / Instructor: Pieter Provoost

MBON Pole to Pole of the Americas: using OBIS as data sharing and integration platform

Category: 2018
The Pole to Pole MBON of the Americas (P2P) and AmeriGEOSS are offering a five-day training program targeting marine scientists in the Americas, from pole to pole, with expertise in coastal ecology. The program will focus on marine biodiversity activities in the field and behind the computer that promote a community of best practices.
  • Course Editor / Instructor: Ward Appeltans
  • Course Editor / Instructor: Eduardo Klein

OBIS Marine Biodiversity Data Management

Category: 2018

El presente curso se presenta como una oportunidad para actualizar la información acerca de los formatos y estándares que se utilizan en OBIS.


OBIS se encuentra en un trayecto de renovación y mejora de ciertos procedimientos, especialmente los que se refieren a los controles de calidad de los datos suministrados. Durante el presente curso se expondrán conceptos y procedimientos sobre: usos de la plataforma OBIS, procedimientos para organizar los datos según ciertos estándres y formatos, ¿cómo publicar datos en OBIS? y cuáles son las mejores prácticas para el aprovechamiento de los datos que se encuentran en OBIS.
  • Course Editor / Instructor: Eduardo Klein
  • Course Editor / Instructor: Ana Carolina Peralta

U.S. Integrated Ocean Observing System (IOOS) Biological Data Training Workshop

Category: 2018

This workshop builds on the successful partnership between the U.S. Integrated Ocean Observing System (IOOS) and the Ocean Biogeographic Information System (OBIS-USA) in coordination with IOC’s OceanTeacher Global Academy, and OBIS international to develop a community of practice around the management and analysis of marine biological data. It will provide hands-on training in a computer lab setting and is intended to educate participants on the benefits, goals, technology and process to standardize biological data (and associated physical or chemical data) and make it accessible via OBIS and IOOS, including the MBON Portal. The workshop will also expose participants to OBIS, IOOS and MBON applications for using those data.

Administración de Datos Biogeográficos Marinos (Contribuyendo al Uso de OBIS)

Category: 2017
El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización. Metas y Objetivos Ampliar la red de colaboradores OBIS. Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos. Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos. Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS. Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicacione…

Administración de Datos Biogeográficos Marinos (Contribuyendo al Uso de OBIS) (Galapagos)

Category: 2017
El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización. Metas y Objetivos Ampliar la red de colaboradores OBIS. Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos. Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos. Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS. Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicacione…

Administración de Datos Biogeográficos Marinos (Contribuyendo al Uso de OBIS) (Merida)

Category: 2017
El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización. Metas y Objetivos Ampliar la red de colaboradores OBIS. Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos. Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos. Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS. Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicacione…
  • Course Editor / Instructor: Ana Carolina Peralta
  • Course Editor / Instructor: Julian Pizarro

Gestion des données sur la biodiversité marine (OBIS)

Category: 2017
ContexteLe cours offre une introduction sur le système d'information biogéographique sur les océans (OBIS). Cela inclut les meilleures pratiques en matière de gestion des données biogéographiques marines, l’organisation, l'analyse et la visualisation de données sur la biodiversité marine. Contenu Développer le réseau de collaborateurs d’OBIS ; Améliorer la qualité des données biogéographiques marines ; Accroître la sensibilisation sur les normes internationales et les meilleures pratiques de gestion de données biogéographiques marines ; Augmenter la quantité de données librement disponibles, publiées par les nœuds OBIS et OBIS ; Augmenter l'utilisation des données d’OBIS pour la science et leur application dans la conservation des espèces et la gestion des res…
  • Course Editor / Instructor: Ward Appeltans

OBIS Asian nodes and Coral Reef

Category: 2017

The course provides an introduction to the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). This includes best practices in marine biogeographic data management, data publication, data access, data analysis and data visualisation.


Aims and Objectives




Reinforce and expand the OBIS network in the South-East Asian Region


Increase awareness on international standards and best practices related to marine biogeographic data management


Increase the amount and quality of open access biodiversity data published through OBIS and its OBIS nodes


Increase the use of data from OBIS for research, species conservation and area-based management applications for sustainable development


OBIS Nodes Training Course

Category: 2017

Training the OBIS nodes and the trainers (at the OBIS nodes and OceanTeacher regional training centres) was considered a top priority at the last SG-OBIS meeting. The training will include: 



The application of ratified Darwin Core terms 

OBIS-ENV-DATA standard (combining sampling events, occurrences, abiotic+ biotic measurements and sampling facts). 

QC tools (including the OBIS tools R package: https://github.com/iobis/obistools

Data publication (IPT), including metadata management 

Data access and visualization (including the OBIS R package: https://github.com/iobis/robis

There will be time for discussions and tackling specific use cases including output.


  • Course Editor / Instructor: Ward Appeltans
  • Course Editor / Instructor: Pieter Provoost