OBIS

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El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización.

Metas y Objetivos

  • Ampliar la red de colaboradores OBIS.
  • Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS.
  • Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicaciones de gestión basadas en áreas.

Category: OBIS

Overview
The course provides an introduction to the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). This includes best practices in marine biogeographic data management, data publication, data access, data analysis and data visualisation. 

Aims and Objectives
- Expand the OBIS network of collaborators
- Improve marine biogeographic data quality
- Increase awareness of international standards and best practices related to marine biogeographic data
- Increase the amount of open access data published through OBIS and its OBIS nodes
- Increase the use of data from OBIS for science, species conservation and area-based management applications

Learning Outcomes
- Knowledge and understanding of OBIS structure, mission and objectives
- Installation and management of IPT
- Use of Darwin Core standards for species occurrence records, taxonomy, event/sample records and additional biological and environmental parameters.
- Data quality control tools
- Publishing data through IPT and contributing datasets to OBIS
- Use of OBIS data access (SQL, web service, API/R). 
- Data visualisation tools (ArGIS online, …) 

Target Audience
- Marine data managers
- Staff of NODCs or ADUs/OBIS nodes working with marine biodiversity data
- Principle Investigators of major marine biodiversity expeditions
- National marine biodiversity focal points

Category: OBIS

A Marine Spatial Planning exercise using OBIS data and many other geographically referenced layers. Participants play a role game in which they have to propose in consensus a different management options for a proposed Marine Managed Area. During the exercise, the participants will practice some of the main principles of the marine spatial planning methodology.

Category: OBIS

The MBON Pole to Pole effort seeks to develop a framework for the collection, use and sharing of marine biodiversity data in a coordinated, standardized manner leveraging on existing infrastructure managed by the Global Ocean Observing System (GOOS; IOC-UNESCO), the GEO Biodiversity Observation Network (GEO BON), and the Ocean Biogeographic Information System (OBIS). The MBON Pole to Pole aims to become a key resource for decision-making and management of living resource across countries in the Americas for reporting requirements under the Intergovernmental Science-Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services (IPBES), Aichi Targets of the Convention of Biological Diversity (CBD), and the UN 2030 Agenda for Sustainable Development Goals (SDGs). 

This course a follow up of the MBON Pole to Pole of the Americas: using OBIS as data sharing and integration platform. The course will take place in Cancun, Mexico, between 2 to 5 April 2019.

This second workshop builds on activities and achieved goals from a first meeting in Sao Sebastiao, Brazil, August 6-10, 2018. The purpose is to continue the development of a community of practice dedicated to understanding change in marine biodiversity and generating knowledge and products that inform conservation and management strategies of marine living resources by engaging researchers, managers and policy-makers with interest in biodiversity monitoring and data synthesis and analysis. During this workshop participants will:
 
  • Advance already agreed field sampling protocols for rocky shores and sandy beaches;
  • Manipulate tabular and spatial data already collected at their study sites for standardized data formats using Darwin Core vocabularies and quality controls;
  • Develop specific vocabularies for flora and fauna of rocky shore and sandy beach measured during field surveys;
  • Publish survey datasets to the Ocean Biogeographic Information System (OBIS) using tools for sharing data;
  • Advance knowledge on data science tools (R, Rmarkdown, Github) to mine data, visualize and analysis, and produce reproducible research documents with interactive visualizations onto the web.

OBIS México

OBIS Training Course (2018) - INIOAS, Iran

Category: OBIS 2018

El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización.

Metas y Objetivos

  • Ampliar la red de colaboradores OBIS.
  • Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS.
  • Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicaciones de gestión basadas en áreas.

Link to event on IODE Calendar: https://www.iode.org/index.php?option=com_oe&task=viewEventRecord&eventID=2001

Category: OBIS 2018

MBON Pole to Pole of the Americas: using OBIS as data sharing and integration platform

Category: OBIS 2018

OBIS Chile

Category: OBIS 2018

Training for EMODnet Biology Partners

Category: OBIS 2018

Summary

This workshop builds on the successful partnership between the U.S. Integrated Ocean Observing System (IOOS) and the Ocean Biogeographic Information System (OBIS-USA) in coordination with IOC’s OceanTeacher Global Academy, and OBIS international to develop a community of practice around the management and analysis of marine biological data. It will provide hands-on training in a computer lab setting and is intended to educate participants on the benefits, goals, technology and process to standardize biological data (and associated physical or chemical data) and make it accessible via OBIS and IOOS, including the MBON Portal. The workshop will also expose participants to OBIS, IOOS and MBON applications for using those data.

Category: OBIS 2018

Overview

The training course Marine Species Distribution modeling covers the background knowledge on marine biogeography, and the technical aspects needed to develop Species Distribution Models. Students will be trained in the basics of statistical modeling and guided through the modeling phases: compile distribution data from open access databases (e.g. OBIS) and environmental information from publically available ecological data layers using Geographic Information Systems, make informed decisions on parameter settings and select the best methods for developing distribution models, forecast distributions under different Climate Change scenarios, validate models and incorporate results in scientific manuscripts and technical reports. The course includes theoretical lectures and hands-on exercises using predominantly case studies of marine macroalgae. Students are encouraged to bring their own datasets.

Learning Outcomes
Understand distributions of marine organism and predict shifts in response to Climate Change.
Develop skills for taking the best decisions and applying the correct statistical tools needed for Species Distribution Modeling (SDM).
Being able to discuss the results of SDM into scientific manuscripts and technical reports, and defend them to a wide audience.
Understand the strengths and limitations when applying SDM to real cases.
Recognize the importance of good practice in Species Distribution Modeling Course Topics Marine biogeographical distributions and niche modeling.
Niche concepts: what niche is being modeled? Basis of Statistical Distribution Modeling.
Definition of correlative and mechanistic SDMs.
Desired properties, modeling phases & decisions, the recipe.
Introduction to GIS and distribution data mining.
Modeling methods (e.g. Bioclim, GLM, Maxent, boosted tree regression)
Equilibrium assumption, transferability and forecasting.
How to write an article/oral presentation using SDMs.

Target Audience:
Marine researchers and postgraduate students (MSc and PhD students) with particular interest in macroalgae or benthic organisms;
NOTE: priority will be given to participants originating from Europe and / or involved in European marine research projects. UNESCO is committed to promote gender equality. Therefore, applications from women are strongly encouraged. Course Pre-requisites Basic knowledge on Ecology & Statistics Need to bring own laptop Working knowledge of English

Venue: Ostend, Belgium

Dates:

Lecturers:

Link to event:

Category: OBIS 2018
Category: OBIS 2018

OBIS Nodes Training Course (2017)

Category: OBIS 2017

Contexte
Le cours offre une introduction sur le système d'information biogéographique sur les océans (OBIS). Cela inclut les meilleures pratiques en matière de gestion des données biogéographiques marines, l’organisation, l'analyse et la visualisation de données sur la biodiversité marine.

Contenu

  • Développer le réseau de collaborateurs d’OBIS ;
  • Améliorer la qualité des données biogéographiques marines ;
  • Accroître la sensibilisation sur les normes internationales et les meilleures pratiques de gestion de données biogéographiques marines ;
  • Augmenter la quantité de données librement disponibles, publiées par les nœuds OBIS et OBIS ;
  • Augmenter l'utilisation des données d’OBIS pour la science et leur application dans la conservation des espèces et la gestion des ressources marines et côtières ;

Category: OBIS 2017

El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización.

Metas y Objetivos

  • Ampliar la red de colaboradores OBIS.
  • Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS.
  • Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicaciones de gestión basadas en áreas.

Link to event on IODE Calendar: https://www.iode.org/index.php?option=com_oe&task=viewEventRecord&eventID=2001

Category: OBIS 2017

El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización.

Metas y Objetivos

  • Ampliar la red de colaboradores OBIS.
  • Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS.
  • Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicaciones de gestión basadas en áreas.

Category: OBIS 2017

El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización.

Metas y Objetivos

  • Ampliar la red de colaboradores OBIS.
  • Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos.
  • Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados através de OBIS y sus nodos del OBIS.
  • Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicaciones de gestión basadas en áreas.

Category: OBIS 2017