Topic outline

  • General

    Información General

    El curso proporciona una introducción al Sistema de Información Biogeográfica de los Océanos (The Ocean Biogeographic Information System - OBIS). Esto incluye las mejores prácticas en la gestión de los datos biogeográficos marinos, publicación de los datos para su libre acceso (IPT), acceso a los datos, organización, análisis y su visualización, utilización de R, y cuáles son las mejores prácticas para el aprovechamiento de los datos que se encuentran en OBIS.

    Metas y Objetivos

    • Ampliar la red de colaboradores OBIS
    • Mejorar la calidad de los datos biogeográficos marinos
    • Aumentar el conocimiento de las normas internacionales y las mejores prácticas relacionadas con los datos biogeográficos marinos
    • Aumentar la cantidad de datos de libre acceso publicados a través de OBIS y sus nodos del OBIS
    • Incrementar el uso de datos de OBIS para la ciencia, la conservación de las especies y las aplicaciones de gestión basadas en áreas

    Resultados del aprendizaje

    • Conocimiento y comprensión de la estructura de OBIS, misión y objetivos.
    • Manejo del IPT.
    • Uso de estándares de Darwin Core para los registros de ocurrencia de especies, taxonomía, eventos/muestra y parámetros biológicos y ambientales adicionales.
    • Uso del lenguaje de programación R para el acceso, análisis y manejo de datos OBIS
    • Herramientas de control de calidad de datos
    • Publicación a través de IPT y conjuntos de datos que contribuyen a OBIS
    • Herramientas de visualización de datos

    Pre-requisitos para el curso

    • Los candidatos deben ser de instituciones que contribuyen, o poseen y planean contribuir con datos biogeográficos marinos a OBIS.
    • Los candidatos deben tener conjuntos de datos biogeográficos marinos para trabajar con ellos durante los ejercicios prácticos.
    • Buen conocimiento y manejo del idioma de español.
    • Habilidades en manejo de Office.
    • Poseer conocimientos básicos del lenguaje R (Recomendable).
    • Tener la disponibilidad de publicar datos en OBIS al finalizar el curso.
    • Es necesario traer computadora portátil

    Instructores:

    Fechas: 14- 18 Enero 2019

    Lugar: Facultad de Ciencias, Universidad Nacional Autónoma de México. Cto. Exterior s/n, Ciudad Universitaria, 04510 Ciudad de México, CDMX

    List of participants

  • Registro del participante

  • Antes de iniciar el curso

    Debes completar las siguientes actividades antes de asistir al curso. Esto te garantizará que tengas tus datos en el formato correcto y con todos los campos requeridos. Por favor revisa la presentación para determinar qué tipo de datos tienes para luego definir el formato en que debes preparar tu conjunto de datos.

  • Cómo interactuar con OBIS: El Portal

    Explora el uso del Portal en http://iobis.org

    • Estructura del conjunto de datos para OBIS

      Para entender cómo debes organizar tu conjunto de datos sigue el paso a paso descrito en la siguiente presentación:

      Indice de DarwinCore 

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      Procedimientos para los controles de calidad de los datos

      Todos los nombres de las especies necesitan ser comparados con un registro de autoridad taxonómica; se comprueban los datos con los campos requeridos por OBIS, así como también con cualquier tipo de dato inválido. OBIS comprueba, rechaza y reporta el estado de los datos a los respectivos nodos pero no realiza ninguna modificación.

      En la siguiente presentación conocerás más detalles del paso a paso para hacer el Control de Calidad de tu conjunto de datos

      • Algunos ejercicios...

      • Cómo interactuar con OBIS: los paquetes para R

        Este módulo te muestra como usar los paquetes de R para OBIS que sirven como herramienta para extraer registros de la base de datos OBIS. Además, te mostraremos cómo usar algunas herramientas de R para ejecutar controles de calidad, producir mapas y resúmenes de los datos. 

      • Control de calidad y acceso de datos en OBIS con R

        • Publicación e Intercambio de datos a través de OBIS

          En esta sección aprenderá cómo se publican los datos en OBIS, cuáles son los procesos y estándares utilizados. Conocerá la estructura organizativa de OBIS: nodos y responsabilidades.

          •  Guia básica del IPT File 1.5MB PDF document
        • Publicación de datos:Data Paper

          • Encuesta Final